Нейросеть научили предсказывать структуру и функции любых белков

В журнале Nature Biotechnology появилась статья о том, что специалистами Google Research и Европейского института биоинформатики разработана нейронная сеть глубокого обучения, позволяющая предсказывать структуру, функции и свойства белков. При этом авторами опубликована интерактивная научная работа с подробным описанием функционирования их нейросети и сравнением с аналогичными проектами.

Разработка облегчит и ускорит создание новых медицинских препаратов и ферментов для биотоплива, химикатов и пищевой промышленности. В каждом случае требуются свои белки с конкретной функцией (образования или разрыва химических связей, переноса электрона и пр.). Создавать белки с нуля человечество не научилось, из-за чего для поиска возможных решений обращается к природе, в том числе микроорганизмам. В результате ежедневно глобальные базы пополняются данными о сотне тысяч новых белковых последовательностей, от которых без описания функций белка толку мало.

Специалисты Google Research и Европейского института биоинформатики обучили свой алгоритм на всемирной базе данных с уже имеющимися описаниями функций белков и дополнили список новыми аннотациями. Благодаря этому записей в базе данных стало почти на 10% больше, включая 360 новых аннотаций о функциях белков человека. Авторы, считают свою работу самым большим обновлением базы за последнее десятилетие.

В начале месяца наш медиаресурс также писал о нейросети Equidock, создающей идеальное соединение двух белков для ускорения синтеза и создания новых медицинских препаратов. Эта разработка принадлежит специалистам Массачусетского технологического института.