Для повышения эффективности вакцин применят искусственный интеллект
Институт искусственного интеллекта AIRI займется повышением эффективности вакцин, заявила научный руководитель институтской группы «Биоинформатика» Ольга Кардымон, выступая на организованной Сбербанком конференции AI Journey. Проект реализуется совместно с НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи, разработчиком вакцины «Спутник V» против коронавируса. Об этом
сообщает РБК.
Институт искусственного интеллекта AIRI был учрежден Сбербанком в декабре 2020 года в форме российской автономной некоммерческой организации. Основная цель — найти возможности применения искусственного интеллекта для решения сложных социальных, экономических и научных задач. За год число сотрудников института выросло до 100 человек, из них 37 — кандидаты и доктора наук, 15 — профессора.
Институтом управляет совет, председатель — Юрген Шмидхубер, немецкий и швейцарский ученый, специализирующийся на обучении нейросетей. Сотрудники входят в 18 команд, работающих над разными направлениями, главные из которых фундаментальные исследования для создания более универсальных, сильных и «умных» алгоритмов и решение практических задач с использованием искусственного интеллекта для медицины, развития науки, а также поддержки промышленности.
По словам Ольги Кардымон, институт займется улучшением иммунологических свойств S-белка, выступающего основным компонентом большинства вакцин от коронавируса. Первый блок работ сводится к тому, чтобы сделать его более привлекательным для антител, способных остановить вирус. Для этого в институте разработали компьютерный дизайн S-белка, в который специально внесли несколько мутаций, чтобы зафиксировать в том положении, в каком он наиболее доступен для нейтрализующих вирус антител.
Вторая разработка института — использование NLP-подхода (обработка естественного языка), который определяет участки белков вируса, распознающиеся иммунной системой. В институте обучают модель, чтобы, во-первых, она определяла, где на поверхности S-белка находятся такие участки. Затем система определяет, вызывают ли они иммунный ответ. В-третьих, в институте предполагают, что такую модель в будущем можно использовать, чтобы оценить, влияют ли отдельные мутации в отдельных положениях на связывание с антителами. Прогнозируя появление таких «злых» мутаций, которые в определенных местах будут влиять на связывание антител с поверхностью вируса, появится возможность попробовать создать дизайн белка, где негативный эффект будет компенсирован. «Мы надеемся, что в результате вакцины станут более эффективными в случае появления новых мутаций и штаммов. На разработку новых вакцин в лабораториях будет уходить меньше времени», — рассказала Ольга Кардымон.
Фото: Julia Koblitz/Unsplash
Подписаться на новости
Обсудить
Институт искусственного интеллекта AIRI был учрежден Сбербанком в декабре 2020 года в форме российской автономной некоммерческой организации. Основная цель — найти возможности применения искусственного интеллекта для решения сложных социальных, экономических и научных задач. За год число сотрудников института выросло до 100 человек, из них 37 — кандидаты и доктора наук, 15 — профессора.
Институтом управляет совет, председатель — Юрген Шмидхубер, немецкий и швейцарский ученый, специализирующийся на обучении нейросетей. Сотрудники входят в 18 команд, работающих над разными направлениями, главные из которых фундаментальные исследования для создания более универсальных, сильных и «умных» алгоритмов и решение практических задач с использованием искусственного интеллекта для медицины, развития науки, а также поддержки промышленности.
По словам Ольги Кардымон, институт займется улучшением иммунологических свойств S-белка, выступающего основным компонентом большинства вакцин от коронавируса. Первый блок работ сводится к тому, чтобы сделать его более привлекательным для антител, способных остановить вирус. Для этого в институте разработали компьютерный дизайн S-белка, в который специально внесли несколько мутаций, чтобы зафиксировать в том положении, в каком он наиболее доступен для нейтрализующих вирус антител.
Вторая разработка института — использование NLP-подхода (обработка естественного языка), который определяет участки белков вируса, распознающиеся иммунной системой. В институте обучают модель, чтобы, во-первых, она определяла, где на поверхности S-белка находятся такие участки. Затем система определяет, вызывают ли они иммунный ответ. В-третьих, в институте предполагают, что такую модель в будущем можно использовать, чтобы оценить, влияют ли отдельные мутации в отдельных положениях на связывание с антителами. Прогнозируя появление таких «злых» мутаций, которые в определенных местах будут влиять на связывание антител с поверхностью вируса, появится возможность попробовать создать дизайн белка, где негативный эффект будет компенсирован. «Мы надеемся, что в результате вакцины станут более эффективными в случае появления новых мутаций и штаммов. На разработку новых вакцин в лабораториях будет уходить меньше времени», — рассказала Ольга Кардымон.
Фото: Julia Koblitz/Unsplash
Назад